ИП — это одно единственное физическое лицо, которое не может быть по своей сути разделено. Поэтому индивидуальные предприниматели не могут быть приравнены к юридическим лицам, и положения ст. 55 Гражданского Кодекса РФ и ст. 11 Налогового Кодекса на них не распространяются. Следовательно, ответ на вопрос: может ли у ИП быть обособленное подразделение — отрицательный. Открывать филиалы, представительства и прочие обособленные подразделения, регистрируя их в налоговых органах — это исключительное право юридических, но никак не физических лиц.
Индивидуальные предприниматели ничем не ограничены в своих возможностях вести коммерческую деятельность во всех регионах страны, в том числе и других муниципальных образованиях. Фактически ИП обособленное подразделение может открывать в виде дополнительных складов, точек продаж, магазинов, пунктов оказания услуг, но подавать при этом заявление в ФНС ему не требуется. С точки зрения законодательства такие пункты продаж, производства и оказания услуг различного формата не будут иметь статуса филиалов, представительств и не будут наделены соответствующими полномочиями. Соответственно платить НДФЛ из зарплаты работающих у него сотрудников, страховые взносы, НДС и прочие налоги ИП будет в регионе по месту своей официальной регистрации, а не по месту фактической ведения деятельности.
Исходя из этого индивидуальный предприниматель, сколько бы кассовых аппаратов не имел по числу точек продаж, всех их должен регистрировать в одной и той же ИФНС по месту своего проживания.